El INMEGEN cuenta con una unidad de información especializada en medicina genómica y áreas afines, el Centro de Información y Documentación (CID). El CID tiene un acervo que abarca temas de Bioinformática, biología celular y molecular, biotecnología, cáncer, diabetes, enfermedades cardiovasculares e infecciosas, estudios éticos, legales y sociales, farmacogenómica, genómica poblacional, nutrigenómica, entre otros.
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| Publicaciones científicas de los investigadores del INMEGEN |
Sequence analysis of mutations and translocations across breast cancer subtypes
Banerji S, Cibulskis K, Rangel-Escareño C, Brown KK, Carter SL, Frederick AM, Lawrence MS, Sivachenko AY, Sougnez C, Zou L, Cortes ML, Fernández-López JC, Peng S, Ardlie KG, Auclair D, Bautista-Pina V, Duke F, Francis J, Jung J, Maffuz-Aziz A, Onofrio RC, Parkin M, Pho NH, Quintanar Jurado V, Ramos AH, Rebollar-Vega R, Rodriguez-Cuevas S, Romero-Cordoba SL, Schumacher SE, Stransky N, Thompson KM, Uribe-Figueroa L, Baselga J, Beroukhim R, Polyak K, Sgroi DC, Richardson AL, Jimenez-Sanchez G, Lander ES, Gabriel SB, Garraway LA, Golub TR, Meléndez-Zajgla J, Toker A, Getz G, Hidalgo-Miranda A, Meyerson M. Sequence analysis of mutations ans translocations across breast cancer subtypes. Nature. 2012 Jun 21; 486(7403):405-9.
El cáncer de mama es la principal causa de muerte en mujeres a nivel mundial, es un conjunto de padecimientos asociados con docenas de mutaciones genéticas distintas. Los hallazgos sobre el origen del cáncer de mama que se presentan en este estudio permitirán prever la efectividad de los tratamientos convencionales y de nuevos medicamentos. |
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Discovery and prioritization of somatic mutations in diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) by hole-exome sequencing.
Lohr JG, Stojanov P, Lawrence MS, Auclair D, Chapuy B, Sougnez C, Cruz-Gordillo P, Knoechel B, Asmann YW, Slager SL, Novak AJ, Dogan A, Ansell SM, Link BK, Zou L, Gould J, Saksena G, Stransky N, Rangel-Escareño C, Fernández-López JC, Hidalgo-Miranda A, Meléndez-Zajgla J, Hernández-Lemus E, Schwawrs-Cruz y Celis A, Imaz-Rosshandler I, Ojesina AI, Jung J, Pedamallus CS, Lander ES, Habermann TM, Cerhan JR, Shipp MA, Getz G, Golub TR. Discovery and prioritization of somatic mutations in diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) by hole-exome sequencing. Proc Natl Acad Sci USA. 2012 , 109(10):3879-84.
En este estudio se analizó la secuencia del genoma completo de 55 muestras de tumores completos de pacientes con Linfoma de células B junto con las de tejido normal. Se identificaron mutaciones recurrentes en genes que son identificados como relevantes en la enfermedad, incluyendo MYD88, CARD11, EZH2, y CREBBP. Además se identificaron mutaciones somáticas en genes de los cuales un rol funcional no ha sido sospechado. |
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Identification and pathway analysis of microRNAs with no previous involvement in breast cancer
Romero-Cordoba S, Rodriguez-Cuevas S, Rebollar-Vega R, Quintanar-Jurado V, Maffuz-Aziz A, Jimenez-Sanchez G, Bautista-Pina V, Arellano-Llamas R, Hidalgo-Miranda A. Identification and pathway analysis of microRNAs with no previous involvement in breast cancer. PLoS One. 2012; 7(3):e31904.
Con la finalidad de evaluar los perfiles de expresión genética en cáncer de mama, se analizó la expresión de 667 microRNAs en 29 tumores y 21 tejidos normales usando arreglos TaqMan de baja densidad. En este estudio se identificó la alterada expresión de varios microRNAs cuya expresión podría ser un impacto importante en las formas relacionadas con cáncer y cuyo rol en cáncer de seno no ha sido descrita previamente. |
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Development of a panel of genome-wide ancestry informative markers to study asmixture througout the Americas.
Galanter JM, Fernandez-Lopez JC , Gignoux CR, Barnholtz-Sloan J, Fernandez-Rozadilla C, Via M, Hidalgo-Miranda A, Contreras AV, Figueroa LU, Raska P, Jimenez-Sanchez G, Zolezzi IS, Torres M, Ponte CR, Ruiz Y, Salas A, Nguyen E, Eng C, Borjas L, Zabala W, Barreto G, Gonzalez FR, Ibarra A, Taboada P, Porras L, Moreno F, Bigham A, Gutierrez G, Brutsaert T, Leon-Velarde F, Moore LG, Vargas E, Cruz M, Escobedo J, Rodriguez-Santana J, Rodriguez-Cintron W, Chapela R, Ford JG, Bustamante C, Seminara D, Shriver M, Ziv E, Burchard EG, Haile R, Parra E, Carracedo A. Development of a panel of genome-wide ancestry informative markers to study admixture throughout the Americas. PLoS Genet. 2012 Mar; 8(3):e1002554.
En este estudio se desarrollo un panel de 446 marcadores de información ancestral (AIMs) optimizados para estimar las proporciones ancestrales en individuos y poblaciones a través de Latinoamérica. |
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Probenecid is a chemosensitizer in cancer stem cell lines.
Campos-Arroyo D, Martinez-Lazcano JC, Melendez-Zajgla J. Probenecid is a chemosensitizer in cancer cell lines. Cancer Chemother Pharmacol. 2012 Feb; 69(2):495-504.
Se examinó la co-administración in vitro de los agentes antineoplásicos cisplatino o paclitaxel con probenecid, un canal inhibidor, en un panel de línea celular para determinar la citotoxicidad y efectos sinergéticos de la combinación del medicamento. Además se midió la clonogenicidad y el índice apoptótico en esas células. |
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Renin is an angiotensin-independent profibrotic mediator: role in pulmonary fibrosis.
Montes E, Ruiz V, Checa M,Maldonado V, Melendez-Zajgla J., Montano M, Ordonez-Razo R, Cisneros J, Garcia-de-Alba C, Pardo A, Selman M. Renin is an angiotensin-independent profibrotic mediator: role in pulmonary fibrosis. Eur Respir J. 2012 Jan; 39(1):141-8.
En este estudio, la expresión de renina y el receptor renina fue examinado en hígados normales y en hígados con fibrosis pulmonar idiopática. Los resultados resaltan que el posible rol de renin como un factor profibrótico independiente angiotensina II en fibrosis.
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Survivin isoform Delta Ex3 regulates tumor spheroid information
Espinosa M, Ceballos-Cancino G, Callaghan R, Maldonado V, Patino N, Ruiz V, Melendez-Zajgla J Survivin isoform Delta Ex3 regulates tumor spheroid formation. Cancer Lett. 2012 May 1; 318(1):61-7
Survivin es un miembro importante del Inhibidor de la familia de Apoptosis de Proteínas y tiene rol esencial en el ciclo de progresión celular. Este gen es comunmente sobreregulado en cáncer y provee un diagnóstico exacto y un blanco terapéutico. En este estudio, se analizó la expresión survivin Delta Ex3 en modelos tridimensionales de tumores avasculares y sus efectos de sobre-expresión en procesos de proliferación, clonogenicidad y apoptosis. |
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